선충은 몸이 분절되지 않은 다세포 무척추동물로 대부분 가늘고 실 같은 형태를 가집니다. 그중 예쁜꼬마선충(Caenorhabditis elegans, C. elegans)은 중요한 연구 모델입니다.
동물 중 최초로 전체 유전체 서열이 해독되었으며 약 20,000개 유전자 중 약 40%가 인간 유전자와 상동성을 가집니다. 짧은 생활사, 높은 번식력, 잘 알려진 발생·해부학적 특성과 다양한 유전적 특성으로 생물학 연구에 널리 활용됩니다.
작고 투명한 선충은 현미경 이미징 기술을 이용하여 관찰합니다. 배양과 선별에는 명시야 또는 경사 조명을 사용할 수 있습니다.
호프만 변조 대비를 이용하면 선충의 미세주입 작업을 지원할 수 있으며 형광 표지와 형광 관찰을 결합하여 더욱 미세한 수준의 연구와 관찰을 수행할 수 있습니다.
선충 배양과 선별에는 충분한 작동 공간과 입체감이 필요하여 실체 현미경을 활용할 수 있습니다. 일반 실체 현미경으로 전체 형태를 관찰할 수 있지만 내부의 세부 구조는 정립 또는 도립 고배율 생물 현미경이 필요하여 광학 성능과 조작 정밀도가 중요합니다.
선충의 투명도 차이와 높은 운동성도 이미징을 어렵게 하므로 형광 표지 및 고정 등의 보조 방법을 고려해야 합니다.